تفاوت در آناتومی پوسته بذر به خوبی مشاهده شده است و میتواند به عنوان ابزاری در ردهبندی و شناسایی گونهها و جنسهای مختلف استفاده شود.
از این نظر، بحث در رابطه با طیف وسیع ساختمان پوسته بذر در میان متخصصان بذر وجود دارد. پوسته بذر از اهمیت بسزایی در رابطه با بذر برخوردار است، زیرا اغلب به عنوان تنها مانع حفاظتی بین جنین و محیط بیرونی محسوب میشود. در بعضی گونهها پوسته میوه و حتی اندوسپرم این نقش را ایفا میکنند. ساختار حفاظتکنندگی که به پوستۀ بذر نسبت داده میشود، به دلیل حضور لایههای کوتیکولی خارجی و درونی اشباع از چربی و موم (مانند سوبرین) و یک یا چند لایه دیواره سلولی نازک و حفاظتی است. این ساختار مکانیکی که در دیواره ثانویه سلولی سنتز میشود، دارای موادی نظیر لیگنین یا موم / چربی ناتراوا است که در نتیجه تولید پلی فنولیکها به عنوان یک محافظ برابر حمله حشرات عمل میکند.